Hallo Oliver,
möglicherweise wurden die Dialoge in einem Skript unterdrückt und nicht mehr aktiviert (z.B. weil das Skript unterbrochen worden ist).
Versuche mal, die Dialoge mit Hilfe des folgenden Skripts wiederzubeleben:
// interactWithAll.jsx
app.scriptPreferences.userInteractionLevel = UserInteractionLevels.interactWithAll;
Wer dieses Skript in den 'Startup Scripts'-Ordner legt, hat die Chance, zumindest nach einem Neustart von InDesign die Dialoge wieder zu Gesicht zu bekommen.