Wenn in InDesign in den allgemeinen Voreinstellungen "beim Einfügen PDF bevorzugen" angewählt ist, dann wird auch PDF eingebettet beim Copy/Paste zwischen Illustrator und Indesign. Sollen Pfade aus Illustrator in InDesign editiert werden, ist die obige Option aber gerade Grund dafür, dass eine Editierung nicht möglich ist.
Copy/Paste macht meines Erachtens dann Sinn, wenn in InDesign beispielsweise eine Form gebraucht wird, die in Illustrator viel schneller per Pathfinder/Filter erstellt wird als in InDesign.
Normale Grafiken sollten aber nach wie vor als AI-File und im Falle von Sonderfarben als EPS (Level 3) importiert werden.
Herzliche Grüsse
Häme Ulrich
http://www.ulrich-media.ch