Unter CS 6 hatte ich das Problem noch nicht, wohl aber unter der CS 4 und 5. Den Grund kann ich dir auch nicht nennen, aber ich habe mir, wie hier auch schon empfohlen, beholfen, indem ich das PDF stückweise ausgab und in Acrobat zusammenfügte.
Das ist, ich weiß, keine Antwort auf deine Frage, die mich ebenfalls sehr interessieren würde. Grob gesagt scheint es wohl weitaus mehr ein Bug von InDesign zu sein – es hilft jedenfalls nicht, mehr RAM einzubauen – als ein wirkliches Speicherproblem. Man könnte vermuten, dass es für die PDF-Ausgabe komplexer Dokumente hin und wieder einfach zu wenig Speicher reserviert.
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