Hallo,
bei solchen Problemen, gäbe es verschiedene Möglichkeiten.
1. Die PDFs als Postscript speichern und neu distillen.
2. Die PDFs in InDesign platzieren und neu als PDF exportieren.
3. Die problematischen PDFs step-by-step identifizieren und diese Seiten dann als Bild rastern und wieder einfügen. Nicht schön, aber wenn es nicht anders geht, sicher besser als den Auftrag zu verlieren.
4. Wenn Acrobat die PDFs nicht kombinieren kann, dann evtl. PDFSAM. Wenn man den Druckauftrag aber nicht unter eigener Kontrolle hat, dann kann das beim Kunden problematisch werden, denn die Fehlermeldung im Acrobat deutet ja auf irgendein Problem hin. Blind zusammenfügen ohne dieses Problem zu lösen, wäre Harakiri. Daher würde ich immer zuerst 1. probieren, womit die PDFs komplett neu erstellt werden.
Gruß