Hallo Verena,
hier ein Beispiel:
syncObjectLayersVisibility.jsx.
Allerdings wird in diesem Beispiel nur in der Schnittmenge (gemeinsame Ebenen der INDD und den einzelnen Bildern) synchronisiert.
Es könnte aber ein Baustein bzw. ein Stück Weg zu der von Dir gewünschten Lösung sein.
Du könntest z.B. im InDesign-Dokument für eine in den Illu-Dateien auszublendende Ebene eine gleichnamige Ebene anlegen und diese im InDesign-Dokument ausblenden. Synchronisierst Du mit dem angegebenen Skript, dann wird die Ebenensichtbarkeit dieser Ebene an diejenige vom Dokument angepasst.