Dieses Forum stellt die Sonderzeichen "?" alls Entity 
 dar!
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Die Fragezeichen tauchen erst nach dem Export auf. Die Positionen sind (soweit ich es durchschaue) willkürlich.
Sie stehen allerdings nie mitten im Fließtext!?
Dieses Beispiel zeigt zwei in InDesing verfasste "Leere Absätze" die direkt aufeinander folgen. Im Exportergebnis hat eines der beiden Tags plötzlich zusätzliche Zeichen.
Öffne ich die XML-Datei mit dem Cooktop-Editor, stellt er an den entsprechenden Stellen Rechtecke anstatt Fragezeichen dar.