Nein, das ist keine blöde Frage. Wenn du aber alles in einer einzigen HTML-Seite hast, indexiert Google halt nur das, was in dem einen DIV drin ist.
Du sprichst von fortgeschrittenen Methoden, mit denen man "deep linking" betreiben kann, d.h. die Adresse im Browser wechselt, sobald man im Flash-Film auf einen neuen Bereich klickt. Solche Methoden sind jedoch nichts für Anfänger.
Hier eine Library, die ich empfehlen kann:
http://www.asual.com/swfaddress/ Doks sind jedoch auch alle in englisch...
Beispiel in der Praxis:
http://www.group94.com/ Klick herum; du wirst sehen wie sich auch die URL im Browser ändert.