Ja, das geht, ist aber zu komplex, um hier in einem Forums-Post auseinandergedröselt zu werden.
Zwei Ansätze:
AppleScript sagt im Laufe eines Scriptes ganz explizit, mit welchen Programm grad geredet wird.
In JavaScript ist es deutlich komplizierter, da der JS-Interpreter in InDesign (oder Photoshop oder Illustrator etc) selbst läuft. Und InDesign kann nicht Photoshop steuern.
Das lässt nur die Möglichkeit, dass InDesign ein Script-Snippet nimmt, verpackt und an Photopshop übergibt, damit Photoshop dann vor sich hin wuseln kann.
Das Schlagwort für diesen Ansatz ist "BridgeTalk"
https://www.google.de/...scripting+bridgetalk