Ich habe es so organisiert, daß die für das Betriebssystem notwendigen Schriften (in aller Regel die, die bei der Installation des Betriebssystems installiert werden) im Ordner /library/fonts liegen.
Alle anderen Schriften liegen in Unterverzeichnissen eines von mir eingerichteten Ordners (/Schriften).
Diese Schriften verwalte ich mit Suitcase.
Du kannnst sie auch mit dem OSX-eigenen Fontmanager "Schriftsammlung" verwalten. Oder mit dem kostenlosen FontExplorer von Linotype (
http://www.linotype.com/fontexplorerX), wenn Du Dich nicht daran störst, daß Dir dieser immer wieder mal eine "benötigte" Schrift über den integrierten Online-Store verkaufen will.