Das "immer" ist falsch. Das passiert nur dann, wenn Sie die Option "Konturen skalieren" im Menü der Kontrollpalette angeschaltet haben. Die meisten Quark-Anwender fahren besser, wenn sie diese Option ausschalten.
Ich frage mich, ob ich nicht dringend mal wieder zum Arzt muss. ;)
Alles zu gruppieren, um leichter wieder drauf zugreifen zu können, ist Quark-Denke, wo es keine abschließbaren Ebenen gab. (Und somit keine Alternative zu Gruppierungen).
Es ist bedauerlich, dass Gruppen in InDesign eine Reihe unangenehmer Nebeneffekte haben, aber wenn man sich einmal an die Alternativen (vor allem das Schichten in Ebenen -> Bereiche sind leicht per PFeil bewegbar) gewöhnt hat, kann man in vielen Fällen auch drauf verzichten.
Ansonsten: dieses Skript de-skaliert die markierten Gruppen inklusive ihrer Untergruppen.