Hallo Mario,
aus InDesign heraus öffnet sich immer das ESTK. Und ich sehe auch keine Option, eine Default-Application festlegen zu können.
Deshalb habe ich mir längst angewöhnt, ein zu editierendes Script vom Mac-Finder aus per Doppelklick zu öffnen. Ich weiß nicht, ob du auf dem Mac oder unter Win unterwegs bist, aber auf dem Mac kannst du die Default-Application für jeden Dateityp über cmd+i festlegen: