Du kannst so viel Zellen kopieren, wie ersetzt werden sollen:
Sollen 2 x 3 Zellen (2 Reihen; 3 Zeilen) ersetzt werden, dann wähle in der Quelltabelle 2 x 3 Zellen aus, kopiere sie und markiere in der Zieltabelle 2 x 3 Zellen und füge den Inhalt der Zwischenablage ein.

Um Inhalte aus Excel in eine InDesign Tabelle zu kopieren, muß Du eventuell den Inhalt der Zwischenablage erst auf der Montagefläche zwischensichern.