Hallo.
Das wäre schön, würde InDesign URLs automatisch in Links umwandeln. Das tut es aber nicht: Hier ist Acrobat die Ursache.
Und auf dessen Performance würde ich mich nicht verlassen. Im Anhang ein PDF, dessen erste beide URLs als Hyperlink verstanden werden von Acrobat – die dritte aber nicht.
Aber gut: Wenn Du das riskieren willst: Workaround könnten kurze URLs sein, wie Du sie auf zahlreichen Webseiten erzeugen kannst. Zum Beispiel hier:
http://tinyurl.com/