Hallo bigmac77,
bis InDesign CS6 (und vermutlich auch bis zur aktuellen CC-Version) ist dies mit Bordmittlen und per Skript nicht möglich.
Aber mit Hilfe des kostenpflichtigen Plugins
Crossreferences Pro funktioniert dies tadellos.
Damit ersparst Du auch andere Probleme (Abstürze), mit denen bei der internen InDesign-Querverweisfunktion zu rechnen ist.
Du kannst die InDesign-eigenen Querverweise verlustfrei nach Crossreferences Pro migrieren.
In der umgekehrten Richtung sind jedoch (aufgrund des höheren Funktionsumfangs von CR Pro) Verluste möglich.