Hallo Michael,

Antwort auf:

Für die restlichen 12 Zeichen funktioniert diese Konvertierung leider nicht, obwohl auch diese Zeichen im OTF-Font enthalten sind. Hier muss ich die Konvertierung manuell durchführen.

Oben hattest Du bereits auf eine Konvertierung über GREP-Ersetzen hingewiesen.
Eventuell wäre bei Schwierigkeiten (uneindeutige Belegung) mit GREP-Ersetzen auch ein Glyphen-Ersetzen in Betracht zu ziehen (unter Berücksichtigung der von Ralf Herrmann oben gemachten Einschränkungen bei den GIDs).