Dynamische Fußnoten werden in InDesign jeweils unter die Textspalte mit dem Verweis gesetzt).
Es ist mit der Fußnotenfunktion nicht möglich, Fußnoten über mehrere Spalten hinweg zu setzen.
Es ist aber möglich, für den Fußnotenapparat eigene, spaltenübergreifende Textrahmen anzulegen, die z.B. verdrängend (Konturenführung) über dem Fließtext liegen.
Vorraussetzung: die Fußnoten werden z.B. vor dem Import in Word in Endnoten umgewandelt. Dann kommen Sie beim Import als (statische) Endnoten an. Dort die Endnoten ausschneiden und in den vorbereiteten verdrängenden Textrahmen einfügen.
Es ist auch möglich, dynamische Fußnoten per Skript in statische Endnoten umzuwandeln (z.B.
MoveFootnotes2NewFrame.jsx).
Noch besser ist die Umwandlung von dynamischen Fußnoten in dynamische Endnoten (dynamisch meint: die Nummerierung wird automatisch angepasst). Hierzu gibt es etwa ein Skript von Peter Kahrel:
foot_to_end.jsx.
Weitere Skripte von Peter Kahrel zu diesem Kontext:
Various foot- and endnote tools Was sind 08/15 Formate?
Wenn es nicht ausreicht, was Word und OpenOffice bieten, und Du die Zeit nicht findest, Dich in InDesign einzuarbeiten, bleibt Dir noch die Möglichkeit, jemanden, der sich in InDesign auskennt, für diesen Job anzuheuern.
Das dürfte günstiger sein, als eine eigene Indesign-Lizenz zu erwerben und sich darin einzuarbeiten.