Richtig, Illustrator kann nur RGB/CMYK-Bilder bearbeiten und erzeugen, das ist noch eine große Einschränkung, besonders weil PDF und auch EPS mehr bietet.
Druckbar sind Effekte bzw. Transparenzen schon, aber nur wenige lassen sich mit den gewählten Druckfarben auch wie gedacht reproduzieren. Wenn du zwei Pantone-Farben mit "Hart Mischen" mischt, kommt dabei im Mischungsbereich was raus, was sich nicht mit diesen beiden Pantonefarben drucken lässt. Das kann nicht mal Indesign. In Indesign sind aber zumindest noch Schatten auf Pantonefarben möglich. Dabei wird ein Trick angewendet, dass der Schatten sich später im Druck physikalisch mischt. Die Schattenpixel sind dann einfach eine Graustufenbild, welches überdruckend über der Sonderfarbe liegt.
Dein vorgeschlagenes Logo benötigt keine Effekte, sondern lässt sich leicht mit Verläufen und normalen Postscript-Funktionen realisieren.
Wolfgang