Falls du Apache + PHP installiert hast, kannst du die Files auch so alle abklappern und durchsuchen, die Endung ist dann egal. Ein kleines Skript genügt dann vollauf. Du müsstest dann einfach kurzfristig die Files in das Web-Verzeichnis kopieren, damit du Zugriff darauf hast.
Oder du verwendest einen guten Text-Editor wie EditPlus. Dann kannst du gleichzeitig in mehreren Files suchen, egal welche Endung. Geht auch mit Dreamweaver 8, Ultra-Edit usw.