Ein Script kann quasi grundsätzlich nur das, was Sie auch mit der Hand/Maus können. Es gibt nur ein, zwei Ausnahmen, wo Adobe etwas eingebaut hat, dem aber (noch) keine Entsprechung in der UI gespendet hat, wie z.B. Wasserzeichen.
Mit anderen Worten: wenn Sie keine Ahnung haben, wie Sie die Markierung mit der Hand machen würden, dann gibt es seeehr wahrscheinlich auch keinen Weg, das per Script zu tun.
In Ihrem Fall würde ich wahrscheinlich eine eigene, nicht-druckende Ebene anlegen und da Striche drauf zeichnen. Das braucht dann eine Funktion im Script, die die Position der geänderten Texte rausfindet und daraufhin malt.
Oder Sie finden einen Ansatz, der die bestehenden Markierungen wie z.B. "Kerning anders als 0" (grün) verwendet.