Hallo Gregor,
die beste Voraussetzung, um eine Antwort zu bekommen: Die Dateien liefern, welche das Problem ohne grosses Rätselraten nachvollziehen lassen.
Wo, bitte, steckt die Funktion "Tag für Element entfernen"? Hier, unter Mac OS X kommt dem am nächsten: Beim Bedienfeld "Tags" das Fly-out-Menü öffnen und den Artikel "Tag löschen..." wählen. Ein kleiner Dialog wird geöffnet und dort steht: "Tag löschen und ersetzen durch:". Und im lokalen Menü kann ein anderer Tag gewählt werden.
Wenn Du mir das InDesign-Dokument zustellst und das Script, dann werde ich versuchen, eine Lösung zu finden.
Gruss, Hans